1271年元朝建立，忽必烈重视医学，积极对外开放，使中国与阿拉伯的医药交流得到较大发展。先后设置西域医药司、京师医药院、广惠司、回回药物院、回回药物局等专门面向回回（元代西域东来的各族人的统称）的医药服务及管理机构。其中广惠司为当时主要的回回医药机构，正三品，负责修制御用回回药物，配置药剂，及诸宿卫士的医疗工作，兼收老弱病残者。主要采用回回医法和药物治病。这些机构的创始人是来自叙利亚西部的拂林（东罗马帝国）人爱薛（Isa，1227—1308），颇有贡献，被封为秦国公，去世后追封为拂林王，他的妻子及五子也参与管理，为回回医药在中国的传播起到重要的作用。回回药物输入主要通过“进贡”，其次是商贸。《饮膳正要》《回回药方》载有许多回回方剂，糖浆制剂已经传入我国。现存《回回药方》较集中地反映了元代与阿拉伯医药交流的史实。同时，元代中国传统医学也传向西亚、西南亚，医生随元军西征，带去中医药。大约在13世纪末14世纪初，伊利汗国丞相、御医拉斯德（Rashid aL-Din al-Hamdsni,1247-1318）主持编译一部波斯文中国医学丛书《伊利汗的中国科学宝藏》，包括《王叔和脉诀》和经络针灸、本草、疾病防治与养生等，这部官修医书促进了中国医药在波斯乃至西南亚伊斯兰地区的传播。元代与阿拉伯的医药交流是古代陆上丝绸之路文化交流的重要一环，对推动东西文化交流具有积极的意义。

【主要参考资料】《中国医学通史》P452